More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0010 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  176  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.52572e-10  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  84.52 
 
 
84 aa  156  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  4.33459e-08  unclonable  2.48153e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  85.71 
 
 
84 aa  156  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.70472e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  85.71 
 
 
84 aa  156  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  84.52 
 
 
84 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.26014e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  84.52 
 
 
84 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.87641e-08  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  84.52 
 
 
84 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.21498e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  84.52 
 
 
84 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.60974e-09  unclonable  1.83144e-12 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  82.14 
 
 
84 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.97043e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  83.33 
 
 
84 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.74009e-06  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  83.33 
 
 
84 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.0216e-09  unclonable  2.04685e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  83.33 
 
 
84 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.25175e-09  unclonable  3.48643e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  80.95 
 
 
84 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.47522e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  77.38 
 
 
84 aa  147  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.31674e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  81.18 
 
 
85 aa  143  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.13833e-09  unclonable  6.36307e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  78.82 
 
 
85 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.91047e-09  unclonable  6.44601e-09 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  63.75 
 
 
85 aa  113  9e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.93457e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  69.57 
 
 
79 aa  112  2e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  58.82 
 
 
85 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.75074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  65 
 
 
85 aa  109  1e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  64.94 
 
 
85 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.85576e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  64.94 
 
 
85 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  64.94 
 
 
85 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  64.94 
 
 
85 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  64.94 
 
 
85 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  5.45149e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  66.2 
 
 
72 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  57.89 
 
 
110 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  66.67 
 
 
91 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  62.03 
 
 
82 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  61.25 
 
 
85 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  64.79 
 
 
85 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  62.34 
 
 
105 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  68.18 
 
 
75 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  68.18 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  65.67 
 
 
75 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  55.56 
 
 
84 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  63.64 
 
 
86 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.69142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  52.7 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  62.86 
 
 
77 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.29723e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.42 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  49.37 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  3.55677e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  62.12 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
107 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  52 
 
 
91 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
132 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  59.09 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
79 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
79 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  62.9 
 
 
69 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  48 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  60 
 
 
82 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  60.94 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  57.53 
 
 
75 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  8.76535e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
83 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  6.135e-06  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  66.18 
 
 
80 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  62.69 
 
 
85 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  62.69 
 
 
85 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  56.92 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  2.92784e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  48.1 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  50.67 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  58.57 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  56.45 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  59.68 
 
 
74 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4540  hypothetical protein  57.14 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  61.29 
 
 
64 aa  87.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  59.68 
 
 
69 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  46.34 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
71 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  59.09 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  56 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  64.62 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  59.68 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  44.74 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  59.09 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.43 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  48.65 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  49.37 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  52.17 
 
 
214 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  48.68 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  51.43 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  51.43 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>