More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0007 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0007  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  100 
 
 
368 aa  752  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.71 
 
 
365 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0201942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2693  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.26 
 
 
363 aa  196  5e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.84 
 
 
337 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273336  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4544  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.82 
 
 
355 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0516  NADH:flavin oxidoreductase  33.84 
 
 
372 aa  187  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.99 
 
 
368 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1003  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.16 
 
 
372 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0269182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1532  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.25 
 
 
374 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0956  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.08 
 
 
375 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0975  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.08 
 
 
375 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2711  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.99 
 
 
362 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0325  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.69 
 
 
380 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  6.87106e-05  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf867  NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.84 
 
 
367 aa  166  6e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0345  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.38 
 
 
380 aa  166  7e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
377 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7286  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
384 aa  164  2e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.423648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2284  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.13 
 
 
384 aa  163  4e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.43 
 
 
1005 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.41 
 
 
330 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0542  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  31.37 
 
 
375 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.99 
 
 
335 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.49 
 
 
329 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2937  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.84 
 
 
365 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  30.49 
 
 
926 aa  154  3e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.25 
 
 
357 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.15 
 
 
412 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  29.7 
 
 
363 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  29.52 
 
 
365 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2008  NADH:flavin oxidoreductase  31.45 
 
 
396 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
377 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  32.09 
 
 
389 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
937 aa  148  1e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.26 
 
 
646 aa  147  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  31.68 
 
 
925 aa  147  2e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.14 
 
 
1004 aa  148  2e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1866  NADH:flavin oxidoreductase  34.38 
 
 
389 aa  148  2e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
371 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  33.03 
 
 
411 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.83 
 
 
411 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.92 
 
 
358 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  33.44 
 
 
685 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  32.78 
 
 
362 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.92 
 
 
411 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  29.87 
 
 
957 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  32.11 
 
 
637 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4953  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.49 
 
 
372 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.46 
 
 
373 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  33.33 
 
 
411 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  32.11 
 
 
925 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.59 
 
 
337 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0271468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.47 
 
 
373 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  33.44 
 
 
370 aa  142  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.46 
 
 
370 aa  141  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.94 
 
 
355 aa  141  2e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.66 
 
 
370 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  32.45 
 
 
370 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  32.82 
 
 
424 aa  140  4e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.55 
 
 
418 aa  140  4e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.71 
 
 
352 aa  140  4e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3367  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.18 
 
 
369 aa  140  4e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.46 
 
 
418 aa  140  5e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.37 
 
 
370 aa  140  5e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12610  NADH:flavin oxidoreductase  35.95 
 
 
368 aa  140  5e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.37 
 
 
370 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.67 
 
 
364 aa  139  9e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.05 
 
 
365 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.74 
 
 
665 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  33.83 
 
 
359 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.58 
 
 
355 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.76 
 
 
355 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.76 
 
 
355 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.03 
 
 
364 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.58 
 
 
355 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.76 
 
 
355 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.91225e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.76 
 
 
355 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.75 
 
 
644 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.06 
 
 
646 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.36 
 
 
365 aa  137  3e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.31 
 
 
654 aa  137  3e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
362 aa  137  3e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00196526  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.74 
 
 
365 aa  137  3e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.65 
 
 
358 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.15 
 
 
390 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484664  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.93 
 
 
355 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  30.29 
 
 
420 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03210  NADH:flavin oxidoreductase  32.73 
 
 
375 aa  136  7e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.94 
 
 
364 aa  136  7e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.13 
 
 
375 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.67 
 
 
355 aa  135  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.34 
 
 
363 aa  135  1e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.66 
 
 
667 aa  135  1e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.53 
 
 
462 aa  135  1e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.7 
 
 
555 aa  135  2e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.496877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2864  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.5 
 
 
364 aa  134  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.94 
 
 
363 aa  134  2e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.65 
 
 
370 aa  135  2e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3010  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.38 
 
 
364 aa  135  2e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  29.22 
 
 
360 aa  134  2e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.85 
 
 
369 aa  134  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>