248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0003 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  100 
 
 
281 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  70.8 
 
 
279 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  70.8 
 
 
279 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  70.07 
 
 
279 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  71.53 
 
 
279 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  68.82 
 
 
281 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  69.71 
 
 
279 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  68.25 
 
 
280 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  68.25 
 
 
280 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  68.25 
 
 
280 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  68.25 
 
 
280 aa  417  1e-115  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  67.88 
 
 
280 aa  415  1e-115  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  69.74 
 
 
282 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  66.55 
 
 
283 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  72 
 
 
280 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  68.36 
 
 
281 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  67.64 
 
 
281 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  65.48 
 
 
280 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  65.83 
 
 
278 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  66.06 
 
 
283 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  66.42 
 
 
283 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  67.38 
 
 
279 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  68 
 
 
281 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  67.27 
 
 
281 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  65.84 
 
 
279 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  66.43 
 
 
284 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  66.19 
 
 
279 aa  387  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  66.78 
 
 
284 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41575e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  66.08 
 
 
284 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  65.48 
 
 
285 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  62.14 
 
 
285 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  65.48 
 
 
279 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  66.08 
 
 
284 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  63.21 
 
 
283 aa  384  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  64.73 
 
 
280 aa  381  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  64.16 
 
 
279 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  66.55 
 
 
281 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  64.06 
 
 
289 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  62.64 
 
 
280 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  65.82 
 
 
283 aa  377  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  66.18 
 
 
279 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  61.23 
 
 
282 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 
276 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  63.3 
 
 
276 aa  355  3e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  58.27 
 
 
276 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  58.63 
 
 
285 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  58.63 
 
 
285 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  58.63 
 
 
285 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  58.63 
 
 
285 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  58.76 
 
 
280 aa  348  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  58.27 
 
 
285 aa  347  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  59.27 
 
 
289 aa  347  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  58.09 
 
 
298 aa  346  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  57.51 
 
 
281 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  59.56 
 
 
276 aa  346  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  59.64 
 
 
281 aa  345  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  58.93 
 
 
280 aa  345  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  58.48 
 
 
280 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  58.12 
 
 
281 aa  341  6e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  58.39 
 
 
278 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  58.24 
 
 
276 aa  339  3e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  58.21 
 
 
278 aa  337  2e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  337  2e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  337  2e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  58.21 
 
 
278 aa  337  2e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  336  2e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  337  2e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  337  2e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  336  3e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  57.88 
 
 
280 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
278 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  59.02 
 
 
287 aa  332  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  57.51 
 
 
280 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  57.51 
 
 
280 aa  330  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  56.99 
 
 
283 aa  322  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  58.39 
 
 
278 aa  322  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
277 aa  312  4e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
277 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
277 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
277 aa  309  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  54.38 
 
 
278 aa  308  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
277 aa  307  1e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  50.54 
 
 
277 aa  307  1e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  50.54 
 
 
277 aa  307  1e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
277 aa  307  1e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  53.99 
 
 
282 aa  305  5e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  52.36 
 
 
281 aa  303  2e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 
282 aa  303  2e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  54.51 
 
 
278 aa  303  2e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  53.17 
 
 
285 aa  303  2e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  52.84 
 
 
282 aa  302  4e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  53.09 
 
 
292 aa  301  7e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  52.84 
 
 
282 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  52.48 
 
 
282 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  52.84 
 
 
282 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0698  S-formylglutathione hydrolase  55.84 
 
 
284 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.380863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  51.8 
 
 
282 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  50.89 
 
 
281 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  52.13 
 
 
282 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  52 
 
 
281 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>