55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0002 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0002  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632911 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03217  hypothetical protein  39.22 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002767  hypothetical protein  40.07 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.306762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  38.97 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.72 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.133794  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1830  hypothetical protein  43.23 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2291  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.68 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0714202  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.62 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1580  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.41 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.930599  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0476  hypothetical protein  37.28 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  38.39 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  38.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  38.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  38.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  38.39 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  38.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  38.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.39 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  38.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  36.8 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  37.95 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  37.95 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  37.95 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  37.95 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  37.67 
 
 		 262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  37.95 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  38.03 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1050  hypothetical protein  37.34 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.246702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2687  hypothetical protein  37.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.58958  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1104  hypothetical protein  37.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0743  hypothetical protein  36.89 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1005  hypothetical protein  37.73 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2844  hypothetical protein  35.18 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0684  hypothetical protein  31.52 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2456  hypothetical protein  30.87 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  0.363451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1157  hypothetical protein  29.54 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0933  hypothetical protein  31.17 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1468  hypothetical protein  27.97 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1340  hypothetical protein  27.16 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  hitchhiker  0.000000601073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.87 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.49 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.96 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.78 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.4 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.07 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.07 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.17 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  30.83 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>