295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0001 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  67.61 
 
 
146 aa  205  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  64.79 
 
 
146 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  66.9 
 
 
146 aa  202  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  1.19397e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  64.79 
 
 
146 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  64.08 
 
 
146 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  6.12205e-11 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  66.2 
 
 
146 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.04179e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  64.08 
 
 
146 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.3992e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  63.7 
 
 
150 aa  200  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  64.08 
 
 
146 aa  197  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  63.01 
 
 
146 aa  196  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  2.43053e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  61.27 
 
 
153 aa  194  4e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  62.33 
 
 
146 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  60.56 
 
 
146 aa  191  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  60.96 
 
 
146 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21939e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  56.85 
 
 
147 aa  183  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  45.45 
 
 
144 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.82543e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  46.85 
 
 
144 aa  144  4e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  44.76 
 
 
146 aa  139  1e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  46.58 
 
 
147 aa  137  4e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.44194e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  46.58 
 
 
147 aa  137  5e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  46.58 
 
 
147 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.43 
 
 
145 aa  136  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  45.89 
 
 
147 aa  136  8e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  45.89 
 
 
147 aa  136  8e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  45.89 
 
 
147 aa  136  8e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  45.89 
 
 
147 aa  136  8e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  46.58 
 
 
146 aa  136  9e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.04961e-08  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  46.58 
 
 
147 aa  136  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  45.21 
 
 
147 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  45.21 
 
 
147 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  45.21 
 
 
147 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  45.21 
 
 
147 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  45.89 
 
 
147 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.52 
 
 
147 aa  133  6e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.76 
 
 
145 aa  132  1e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  44.37 
 
 
159 aa  132  2e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  6.40858e-05  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  45.45 
 
 
144 aa  132  2e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.22 
 
 
151 aa  128  2e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  45.21 
 
 
146 aa  126  1e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  45.21 
 
 
146 aa  126  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.45912e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  45.21 
 
 
146 aa  126  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.981e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 
147 aa  125  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 
147 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  41.1 
 
 
147 aa  117  4e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  41.78 
 
 
147 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  37.82 
 
 
165 aa  107  4e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  38.85 
 
 
149 aa  107  8e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  36.91 
 
 
154 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  36.91 
 
 
154 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  36.91 
 
 
154 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  34.9 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  35.42 
 
 
154 aa  94.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  36.11 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.11 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  36.11 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  36.11 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  34.03 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  34.72 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  32.21 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  34.72 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  34.03 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  34.72 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.55 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  34.72 
 
 
149 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  37.5 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  34.72 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  35.42 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  35.42 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  35.42 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  36.11 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  36.11 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.61903e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  35.42 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  34.72 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  33.33 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  33.33 
 
 
154 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  33.33 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  32.64 
 
 
149 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  33.56 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  30.87 
 
 
154 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  38.51 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  34.72 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  38.51 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  36.11 
 
 
151 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  33.33 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  30.56 
 
 
150 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  35.37 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.46 
 
 
148 aa  82.4  2e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  36.99 
 
 
149 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  81.6  3e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  81.6  3e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  81.6  3e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.21 
 
 
148 aa  81.3  4e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  31.29 
 
 
149 aa  80.9  6e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  31.94 
 
 
154 aa  78.2  3e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  38.93 
 
 
150 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.96 
 
 
153 aa  77.8  4e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2284  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.56 
 
 
147 aa  77.4  6e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0673  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.75 
 
 
152 aa  77  9e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  35.57 
 
 
150 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>