More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3185 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  74.37 
 
 
519 aa  769    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
514 aa  1035    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  69.25 
 
 
510 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.13 
 
 
534 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.65 
 
 
524 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.22 
 
 
524 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  50.72 
 
 
524 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.85 
 
 
527 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.02 
 
 
524 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.75 
 
 
517 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.14 
 
 
527 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.12 
 
 
511 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.15 
 
 
527 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.94 
 
 
508 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.44 
 
 
517 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.95 
 
 
526 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.86 
 
 
509 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.52 
 
 
527 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.52 
 
 
524 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.44 
 
 
525 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.04 
 
 
519 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.09 
 
 
521 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.21 
 
 
518 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.88 
 
 
520 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.82 
 
 
523 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.89 
 
 
524 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.39 
 
 
509 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.49 
 
 
529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.15 
 
 
522 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.76 
 
 
520 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.26 
 
 
509 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.89 
 
 
524 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.4 
 
 
509 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.12 
 
 
523 aa  359  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.43 
 
 
493 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.63 
 
 
525 aa  351  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.68 
 
 
520 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.3 
 
 
512 aa  334  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.61 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.75 
 
 
500 aa  323  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  39.41 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.71 
 
 
530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.24 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.12 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.37 
 
 
522 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.28 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.15 
 
 
546 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.51 
 
 
547 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.52 
 
 
553 aa  302  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.95 
 
 
480 aa  299  9e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.52 
 
 
522 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.66 
 
 
561 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.94 
 
 
514 aa  297  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38 
 
 
521 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.45 
 
 
506 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.91 
 
 
504 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.5 
 
 
517 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.03 
 
 
553 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.47 
 
 
525 aa  289  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.44 
 
 
517 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.18 
 
 
546 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.7 
 
 
549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0481  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.35 
 
 
560 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0128618  hitchhiker  0.0000163657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0305  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.35 
 
 
560 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.88 
 
 
521 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.73 
 
 
521 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.9 
 
 
521 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.44 
 
 
549 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
549 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
549 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.51 
 
 
521 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
549 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
549 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.85 
 
 
557 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.8 
 
 
549 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.71 
 
 
522 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.31 
 
 
549 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.62 
 
 
547 aa  279  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.26 
 
 
534 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  35.07 
 
 
549 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.47 
 
 
545 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.48 
 
 
544 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  39.74 
 
 
544 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.66 
 
 
521 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.21 
 
 
549 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.79 
 
 
544 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.96 
 
 
556 aa  276  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.84 
 
 
525 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.6 
 
 
540 aa  276  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.21 
 
 
551 aa  276  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.4 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.44 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.44 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.41 
 
 
543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.44 
 
 
537 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.48 
 
 
549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.89 
 
 
549 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.89 
 
 
525 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.89 
 
 
525 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.89 
 
 
525 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>