114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3174 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
417 aa  853  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  58.53 
 
 
424 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  39.91 
 
 
470 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  41.24 
 
 
440 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  33.73 
 
 
438 aa  272  8e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 
434 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  1.5326e-08 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  32.94 
 
 
437 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  33.41 
 
 
437 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
437 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  33.18 
 
 
437 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  33.41 
 
 
437 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  33.41 
 
 
437 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  33.41 
 
 
437 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
437 aa  265  9e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  32.86 
 
 
437 aa  259  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  37 
 
 
437 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  35.63 
 
 
428 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  35.32 
 
 
460 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  34.44 
 
 
429 aa  253  4e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  35.86 
 
 
486 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  36.79 
 
 
464 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.93 
 
 
464 aa  240  3e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  34.03 
 
 
438 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  1.56043e-06 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  34.37 
 
 
423 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  34.97 
 
 
437 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  35.7 
 
 
442 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  35.1 
 
 
447 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  36.67 
 
 
432 aa  233  4e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  32.3 
 
 
412 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  35.29 
 
 
425 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
469 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  34.03 
 
 
441 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  33.8 
 
 
452 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  31.07 
 
 
434 aa  220  4e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  32.95 
 
 
437 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.25 
 
 
409 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  33.87 
 
 
473 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  32.24 
 
 
435 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  33.48 
 
 
475 aa  216  6e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  34.1 
 
 
433 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  33.73 
 
 
415 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  33.02 
 
 
411 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  37.35 
 
 
466 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  32.54 
 
 
415 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  32.3 
 
 
415 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.41 
 
 
445 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  33.41 
 
 
439 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  32.34 
 
 
438 aa  200  4e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  31.11 
 
 
439 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.3 
 
 
427 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  29.4 
 
 
445 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.31 
 
 
436 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
418 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.62 
 
 
478 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 
418 aa  140  5e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 
417 aa  136  7e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.47 
 
 
427 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.35 
 
 
448 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.42 
 
 
574 aa  118  2e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  27.9 
 
 
421 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  27.19 
 
 
421 aa  112  1e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  39.66 
 
 
424 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  28.3 
 
 
423 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  23.39 
 
 
437 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.51 
 
 
429 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  26.24 
 
 
556 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  24.13 
 
 
413 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.42311e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
446 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.79 
 
 
449 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  27.87 
 
 
430 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  24.35 
 
 
483 aa  90.1  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.33 
 
 
462 aa  82.8  1e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  29.35 
 
 
246 aa  82.4  1e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  23.24 
 
 
572 aa  79  2e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.8 
 
 
504 aa  70.5  5e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  42.68 
 
 
376 aa  67.4  5e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.04 
 
 
642 aa  64.3  4e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  29.31 
 
 
466 aa  59.3  1e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  27.09 
 
 
452 aa  58.5  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  23.71 
 
 
455 aa  58.2  3e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  26.75 
 
 
366 aa  56.6  8e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  37.68 
 
 
69 aa  52  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  30.99 
 
 
558 aa  52.4  2e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 
452 aa  51.6  3e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  25.57 
 
 
466 aa  50.1  7e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.09 
 
 
436 aa  49.7  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.25 
 
 
478 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.6 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  25.81 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.85 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  19.39 
 
 
475 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  24.81 
 
 
539 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  37.17 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.75 
 
 
478 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  31.12 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 
465 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.39 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1084  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>