More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3138 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
573 aa  1127    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  50.79 
 
 
588 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  48.26 
 
 
522 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  34 
 
 
541 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  36.15 
 
 
523 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  36.15 
 
 
523 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
534 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  32.87 
 
 
536 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  33.46 
 
 
557 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  32.37 
 
 
536 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  33.1 
 
 
536 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  32.99 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  32.57 
 
 
536 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  31.23 
 
 
576 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
550 aa  194  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 
532 aa  190  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  33.39 
 
 
487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  32.12 
 
 
532 aa  183  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.71 
 
 
510 aa  183  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 
532 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  32.72 
 
 
528 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  31.7 
 
 
531 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 
567 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  36.57 
 
 
566 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  32.66 
 
 
567 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 
497 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  29.93 
 
 
500 aa  173  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.27 
 
 
537 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 
543 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.36 
 
 
509 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  28.28 
 
 
541 aa  171  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 
503 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.4 
 
 
503 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  30.82 
 
 
564 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  28.06 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  29.76 
 
 
567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  28.82 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
525 aa  163  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
582 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  39.46 
 
 
495 aa  163  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  28.11 
 
 
509 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  31.06 
 
 
556 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
508 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
515 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
567 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  29.66 
 
 
534 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
515 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
515 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  27.06 
 
 
497 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  30.4 
 
 
523 aa  160  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
529 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
529 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
529 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.24 
 
 
542 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
529 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.21 
 
 
529 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.19 
 
 
519 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.77 
 
 
495 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  28.82 
 
 
562 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
507 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
507 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
504 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.75 
 
 
512 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  28.71 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  29.49 
 
 
534 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.21 
 
 
501 aa  157  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 
504 aa  156  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  28.93 
 
 
511 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  30.55 
 
 
510 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.23 
 
 
512 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 
537 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
506 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  37.13 
 
 
495 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.4 
 
 
512 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  32.45 
 
 
553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
512 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.82 
 
 
512 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  29.55 
 
 
505 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
567 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
567 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.4 
 
 
512 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.4 
 
 
512 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.89 
 
 
512 aa  153  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 
500 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
511 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  35.83 
 
 
540 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
518 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  30.67 
 
 
528 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  31.02 
 
 
509 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  29.28 
 
 
543 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
541 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 
479 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 
571 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
501 aa  150  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.18 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  26.23 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  28.5 
 
 
509 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>