More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3102 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  911    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  68.19 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  62 
 
 
458 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  50.92 
 
 
436 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  49.53 
 
 
436 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  54.99 
 
 
434 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  47.32 
 
 
430 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  51.09 
 
 
452 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  48 
 
 
424 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  47.29 
 
 
424 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  47.99 
 
 
431 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  48.48 
 
 
429 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  47.04 
 
 
431 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  46.48 
 
 
431 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  47.37 
 
 
433 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  45.75 
 
 
425 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  48.16 
 
 
425 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  52.48 
 
 
403 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  48.35 
 
 
434 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  49.05 
 
 
424 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  49.05 
 
 
424 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  43.71 
 
 
437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  44.21 
 
 
436 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  41.3 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  39.42 
 
 
447 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  40.33 
 
 
440 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  38.77 
 
 
439 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  41.47 
 
 
428 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  39.03 
 
 
439 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  39.03 
 
 
439 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  39.73 
 
 
439 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  41.65 
 
 
437 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  39.58 
 
 
435 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  38.76 
 
 
433 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  39.63 
 
 
442 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  41.61 
 
 
437 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  40.67 
 
 
443 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  40.67 
 
 
443 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  41.26 
 
 
442 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  35.94 
 
 
443 aa  282  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  38.69 
 
 
432 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  38.89 
 
 
448 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  39.72 
 
 
441 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 
439 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  41.04 
 
 
464 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  38 
 
 
441 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  37.33 
 
 
441 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  35.93 
 
 
456 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  39.25 
 
 
441 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  39.37 
 
 
438 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.35 
 
 
417 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
443 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  37.74 
 
 
442 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  38.26 
 
 
444 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  37.91 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  37.91 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  38 
 
 
443 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  38.86 
 
 
439 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  36.74 
 
 
436 aa  272  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  36.71 
 
 
407 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  35.93 
 
 
436 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  37.24 
 
 
436 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  38.61 
 
 
432 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  39.91 
 
 
432 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  36.57 
 
 
447 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  40.32 
 
 
452 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  38.33 
 
 
430 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  39.17 
 
 
432 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  36.04 
 
 
460 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.59 
 
 
432 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  39.71 
 
 
435 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  32.25 
 
 
441 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  37.47 
 
 
429 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  40.42 
 
 
445 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.66 
 
 
465 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  37.27 
 
 
437 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.42 
 
 
479 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  38.39 
 
 
447 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  31.99 
 
 
437 aa  245  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
433 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  36.93 
 
 
428 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.65 
 
 
453 aa  239  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  34.19 
 
 
426 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  36.32 
 
 
440 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  36.55 
 
 
439 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  36.26 
 
 
443 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
425 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
444 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  38.8 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  35.2 
 
 
443 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
437 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  33.71 
 
 
434 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  31.16 
 
 
439 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  32.17 
 
 
447 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  36.41 
 
 
440 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  33.87 
 
 
443 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
442 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.34 
 
 
447 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  36.62 
 
 
438 aa  227  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  29.47 
 
 
442 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>