239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3081 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.45 
 
 		 932 aa  686    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.21 
 
 		 949 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.52 
 
 		 985 aa  734    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.86 
 
 		 949 aa  716    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  46.6 
 
 		 939 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 		 994 aa  762    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.33 
 
 		 998 aa  755    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  67.12 
 
 		 929 aa  1170    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.57 
 
 		 1075 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.12 
 
 		 918 aa  719    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.38 
 
 		 920 aa  785    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1006 aa  741    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.85 
 
 		 928 aa  755    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.65 
 
 		 1085 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.61 
 
 		 1004 aa  762    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.44 
 
 		 1008 aa  755    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.28 
 
 		 1009 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.37 
 
 		 937 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.95 
 
 		 1088 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.9 
 
 		 933 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.78 
 
 		 928 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.63 
 
 		 957 aa  689    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  49 
 
 		 929 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.1 
 
 		 970 aa  729    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.68 
 
 		 994 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.18 
 
 		 933 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.85 
 
 		 923 aa  726    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.18 
 
 		 929 aa  749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.77 
 
 		 1009 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  43.96 
 
 		 921 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 889 aa  1780    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.28 
 
 		 994 aa  754    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.44 
 
 		 946 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.41 
 
 		 926 aa  711    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.09 
 
 		 947 aa  693    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.82 
 
 		 1002 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.98 
 
 		 1001 aa  736    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.44 
 
 		 998 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.33 
 
 		 1030 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.28 
 
 		 1009 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  44.3 
 
 		 945 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.44 
 
 		 946 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.1 
 
 		 936 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.35 
 
 		 936 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.7 
 
 		 951 aa  724    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.68 
 
 		 982 aa  738    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.54 
 
 		 949 aa  718    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 		 994 aa  762    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.83 
 
 		 930 aa  712    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.24 
 
 		 934 aa  732    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 		 994 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 		 994 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 		 1024 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.44 
 
 		 946 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.76 
 
 		 994 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.37 
 
 		 937 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.08 
 
 		 950 aa  722    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  44.54 
 
 		 905 aa  608  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.23 
 
 		 931 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.25 
 
 		 884 aa  571  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.18 
 
 		 929 aa  561  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.73 
 
 		 940 aa  555  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.46 
 
 		 929 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.31 
 
 		 931 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.9 
 
 		 906 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.1 
 
 		 952 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.7 
 
 		 933 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.45 
 
 		 938 aa  489  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.98 
 
 		 929 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.98 
 
 		 929 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.51 
 
 		 957 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.07 
 
 		 995 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 		 926 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.11 
 
 		 882 aa  456  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.83 
 
 		 932 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 		 926 aa  452  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 		 929 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.93 
 
 		 1021 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 1007 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 		 939 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.41 
 
 		 997 aa  442  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 		 931 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.83 
 
 		 994 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.55 
 
 		 989 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 		 994 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.39 
 
 		 989 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.51 
 
 		 896 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.44 
 
 		 1024 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.44 
 
 		 1024 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.39 
 
 		 989 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 		 938 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.78 
 
 		 1023 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 		 898 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 		 946 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.97 
 
 		 947 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.09 
 
 		 1002 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 1018 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 		 1017 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.03 
 
 		 938 aa  426  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.41 
 
 		 1038 aa  425  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>