More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3058 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 435 aa  855    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  56.51 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  52.35 
 
 		 321 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  51.11 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  42.17 
 
 		 456 aa  242  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  45.07 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  46.47 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  45.26 
 
 		 432 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 322 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  39.08 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  32.7 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.73 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  37.36 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.36 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.36 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.36 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  37.36 
 
 		 449 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  37.36 
 
 		 449 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  36.03 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  37.08 
 
 		 806 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 807 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  33.22 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  34.85 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  33.92 
 
 		 840 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  31.63 
 
 		 301 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.98 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 505 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  36.56 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 685 aa  156  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 784 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  39.61 
 
 		 842 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 981 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 752 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  30.85 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 795 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 298 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  37.82 
 
 		 636 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.96 
 
 		 825 aa  149  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  37.82 
 
 		 636 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 864 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 		 637 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 426 aa  146  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 816 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 		 862 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 859 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  33.53 
 
 		 844 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 832 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  38.92 
 
 		 1235 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  30.61 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  36.18 
 
 		 1111 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  33.94 
 
 		 1110 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  36.62 
 
 		 861 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 843 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 1067 aa  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 1067 aa  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  32.65 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 1127 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 796 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.6 
 
 		 1144 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 1078 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  33.33 
 
 		 1067 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 1067 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 1072 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 1072 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 1072 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  30.67 
 
 		 1080 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 1067 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 830 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 845 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  33.57 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  32.93 
 
 		 753 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 1068 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 1105 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>