41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3018 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 343 aa  670    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  41.69 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  34.05 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  29.38 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  28.99 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  30.06 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  27.22 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  27.89 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  29.22 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  27.61 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  27.43 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  26.99 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  30.08 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  30.08 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  21.9 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  26.28 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  27.49 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  28.05 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  25.29 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  25.89 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  26.57 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  29.28 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  20.06 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  29.96 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  24.12 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  28.95 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  28.18 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  28.18 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  25.57 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  20.25 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  20 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.73 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  25.52 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  25.73 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.33 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>