45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3017 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  62.03 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  62.66 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.62 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.62 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.43 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.43 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.89 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  60 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  57.24 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  60 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.28 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.14 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.14 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  57.53 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.44 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.56 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  41.46 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  32.92 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  31.48 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  33.54 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  30.86 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  35.4 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  31.65 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  36.07 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  36.97 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  36.97 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  34.43 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  31.21 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  36.59 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  33.33 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  32.52 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  35.77 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  31.2 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.87 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  38.24 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  27.56 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  38.18 
 
 		 86 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>