More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3000 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  84.03 
 
 
267 aa  399  1e-110  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  82.77 
 
 
258 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  63.27 
 
 
252 aa  320  1e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  64.85 
 
 
244 aa  320  2e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  64.75 
 
 
253 aa  318  8e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  64.52 
 
 
321 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  63.6 
 
 
288 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  66.12 
 
 
267 aa  315  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
336 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  62.08 
 
 
253 aa  312  4e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  62.08 
 
 
253 aa  312  4e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  64.85 
 
 
310 aa  312  4e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  65.4 
 
 
316 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  64.85 
 
 
263 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  63.6 
 
 
264 aa  310  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  65.82 
 
 
282 aa  309  3e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.51 
 
 
253 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  63.45 
 
 
254 aa  308  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  61.76 
 
 
249 aa  307  1e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  64.56 
 
 
317 aa  306  2e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  60.91 
 
 
256 aa  306  2e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  64.98 
 
 
333 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  62.86 
 
 
290 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  63.27 
 
 
289 aa  305  4e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  64.56 
 
 
332 aa  305  5e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  62.6 
 
 
283 aa  305  5e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  64.56 
 
 
317 aa  305  5e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.22 
 
 
268 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  64.56 
 
 
314 aa  304  9e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  64.22 
 
 
258 aa  304  1e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.26 
 
 
289 aa  303  1e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  64.22 
 
 
258 aa  303  1e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  61.69 
 
 
311 aa  303  3e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  63.36 
 
 
261 aa  303  3e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  62.93 
 
 
279 aa  301  6e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  63.14 
 
 
282 aa  301  7e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
277 aa  301  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
254 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  62.93 
 
 
270 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  61.21 
 
 
249 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  59.49 
 
 
264 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  55.7 
 
 
244 aa  289  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.12 
 
 
244 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60.26 
 
 
241 aa  285  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.7 
 
 
243 aa  284  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  9.37515e-06 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  54.85 
 
 
244 aa  284  1e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.97 
 
 
243 aa  283  2e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  54.85 
 
 
244 aa  283  2e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.56 
 
 
241 aa  283  2e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  56.22 
 
 
254 aa  282  3e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  54.85 
 
 
244 aa  283  3e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  58.37 
 
 
240 aa  283  3e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
243 aa  282  4e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
261 aa  282  4e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  57.94 
 
 
258 aa  282  5e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  57.94 
 
 
258 aa  282  5e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  57.94 
 
 
258 aa  282  5e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  55.83 
 
 
240 aa  282  5e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.14 
 
 
241 aa  281  6e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.33 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  56.47 
 
 
244 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  57.54 
 
 
261 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  57.54 
 
 
258 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  56.75 
 
 
258 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
241 aa  279  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.54 
 
 
240 aa  279  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  54.01 
 
 
244 aa  279  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  57.54 
 
 
258 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  58.66 
 
 
264 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.54 
 
 
258 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  57.94 
 
 
260 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  54.83 
 
 
268 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
239 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
241 aa  276  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.38 
 
 
240 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  54.51 
 
 
243 aa  276  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  59.26 
 
 
256 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.51 
 
 
241 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  56.84 
 
 
241 aa  275  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 
241 aa  275  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 
245 aa  275  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  62.03 
 
 
241 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  62.03 
 
 
241 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  53.59 
 
 
244 aa  274  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  59.24 
 
 
243 aa  274  1e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91993e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  274  1e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 
262 aa  273  1e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.39 
 
 
247 aa  273  2e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  54.43 
 
 
247 aa  273  2e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 
246 aa  273  2e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  55.36 
 
 
239 aa  273  2e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  2.81481e-11 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
241 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>