41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2891 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  565  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  41.1 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  43.99 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  28.72 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  30.04 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  32.51 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.32 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  32.52 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  32.52 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  32.51 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  24.67 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  27.39 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  25.96 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  30.42 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  31.36 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  23.58 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  26.74 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  26.74 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  28.96 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  28.96 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  26.8 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  28.67 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  23.34 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  27.23 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  23.34 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  25.89 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  25.56 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  32.97 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  23.95 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  24.89 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  24.14 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1255  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  29.66 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>