More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2883 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.92 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  23.81 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  36.17 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  29.49 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  38.75 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  38.75 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  30 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>