More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2856 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  73.85 
 
 
259 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  73.85 
 
 
258 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  61.45 
 
 
276 aa  318  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.34 
 
 
317 aa  316  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.87 
 
 
264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.77 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.85 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.45 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.39 
 
 
289 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.07 
 
 
286 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.07 
 
 
271 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  57.92 
 
 
283 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.69 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.69 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  59.77 
 
 
264 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  57.43 
 
 
256 aa  305  6e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  55.82 
 
 
255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  60.23 
 
 
265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  60.23 
 
 
265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.69 
 
 
284 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  59.53 
 
 
264 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.39 
 
 
286 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60 
 
 
263 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.4 
 
 
270 aa  299  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.61 
 
 
286 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.61 
 
 
286 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.54 
 
 
285 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  58.3 
 
 
265 aa  296  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.18 
 
 
282 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.78 
 
 
279 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  59.22 
 
 
285 aa  292  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.97 
 
 
282 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.42 
 
 
282 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  58.63 
 
 
259 aa  287  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  56.18 
 
 
268 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54 
 
 
279 aa  275  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  55.06 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.33 
 
 
270 aa  269  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.4 
 
 
265 aa  268  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  54.02 
 
 
280 aa  268  8.999999999999999e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.22 
 
 
258 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.17 
 
 
270 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.66 
 
 
295 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  55.02 
 
 
270 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
294 aa  263  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.01 
 
 
253 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.39 
 
 
256 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
284 aa  261  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
255 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  49.02 
 
 
253 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.18 
 
 
273 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
256 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  50.6 
 
 
294 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51 
 
 
262 aa  258  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
257 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  51.81 
 
 
273 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.23 
 
 
253 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.05 
 
 
265 aa  258  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  48.44 
 
 
257 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.39 
 
 
262 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
262 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
262 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
262 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
262 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
258 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  49.01 
 
 
261 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.01 
 
 
256 aa  256  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  51 
 
 
262 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
262 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  49.4 
 
 
257 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  48.05 
 
 
265 aa  255  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  56.18 
 
 
274 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.8 
 
 
261 aa  255  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.23 
 
 
253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.18 
 
 
274 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  50.6 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  50.6 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  50.6 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  51 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.61 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  49 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  49.21 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  48.81 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  48.59 
 
 
257 aa  252  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 
257 aa  252  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.81 
 
 
257 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  51.6 
 
 
275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  49 
 
 
348 aa  252  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.83 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>