More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2851 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  75.98 
 
 
232 aa  357  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  59.73 
 
 
232 aa  278  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  45.49 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  46.04 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  47.91 
 
 
233 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  39.91 
 
 
407 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
411 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  42.86 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  40.53 
 
 
420 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  40.34 
 
 
407 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  41.59 
 
 
409 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 
250 aa  164  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  39.83 
 
 
433 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  39.38 
 
 
410 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  41.26 
 
 
413 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  41.26 
 
 
413 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  41.4 
 
 
408 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
415 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  39.13 
 
 
409 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 
415 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  36.96 
 
 
236 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  37.77 
 
 
230 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
230 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  39.13 
 
 
409 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 
415 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 
415 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  37.77 
 
 
230 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  33.95 
 
 
234 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  36.91 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
232 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
230 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.69 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  36.05 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  39.47 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  39.21 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  37 
 
 
237 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  37.83 
 
 
227 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  37.44 
 
 
236 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  39.09 
 
 
229 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  37.73 
 
 
229 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
240 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
223 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  38.56 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 
223 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.74 
 
 
251 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  34.68 
 
 
229 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
229 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
229 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  31.31 
 
 
234 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.62 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  29.73 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  29.82 
 
 
229 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 
221 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  29.49 
 
 
252 aa  92  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  28.21 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  35.83 
 
 
291 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.13 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 
227 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  32.81 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  31.05 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  31.39 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 
302 aa  85.1  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.12 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  26.86 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  36.77 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  35.2 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24560  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.96 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.278572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  28.75 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>