More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2807 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 105 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  78.85 
 
 		 105 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  76.92 
 
 		 105 aa  153  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  68 
 
 		 115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  59.43 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  117  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 103 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  60.95 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  60.61 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  57.55 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  58.59 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  58.59 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  64.42 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  47.79 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  51 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50.48 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  42.42 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  51.61 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0071  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  47.92 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3984  ribosomal protein L24  50 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>