More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2798 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  72.19 
 
 		 455 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 457 aa  919    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  72.81 
 
 		 455 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  61.37 
 
 		 443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  59.08 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  59.38 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  59.08 
 
 		 446 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  59.52 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  59.73 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  57.33 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  58.99 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  57.96 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  59.52 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  58.85 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  57.52 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  57.52 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  58.19 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  57.96 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  59.96 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  57.33 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  56.64 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  57.52 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  56.64 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  58.41 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  57.55 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  59.08 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  57.55 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  57.55 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  57.99 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  57.52 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  56.77 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  57.33 
 
 		 446 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  56.6 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  52.98 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  52.76 
 
 		 457 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  52.76 
 
 		 452 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  52.76 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  53.2 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  52.02 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  51.77 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  53.2 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  52.23 
 
 		 443 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  53.24 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  53.13 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  52.42 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  53.47 
 
 		 444 aa  458  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  53.47 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  53.1 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  53.1 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  51.24 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  52.41 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  53.69 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  52.41 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  52.18 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  53.46 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  52.18 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  51.82 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  53.23 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  53.81 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  53.46 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  53.69 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  53.46 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  52.53 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  53.1 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  53 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  50.34 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  51.79 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  50.88 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  53 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  50.34 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  53 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  53.23 
 
 		 446 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  53.23 
 
 		 446 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.85 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  53.23 
 
 		 446 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  53 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  54.27 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  50.7 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  51.83 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  53 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  52.01 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0621  preprotein translocase, SecY subunit  52.41 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  51.16 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03151  protein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0325718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0413  preprotein translocase, SecY subunit  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3494  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000269315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3685  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4623  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000434636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0303  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000136571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3595  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0292752  normal  0.0168396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3731  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00374977  hitchhiker  0.00528746 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0602  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129742  normal  0.608925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3894  preprotein translocase subunit SecY  54.06 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000749966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>