More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2791 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  47.8 
 
 		 925 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  51.32 
 
 		 876 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 910 aa  776    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  51.99 
 
 		 908 aa  790    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  49.43 
 
 		 883 aa  740    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 		 820 aa  637    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  50.79 
 
 		 910 aa  777    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  51.6 
 
 		 905 aa  677    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  51.81 
 
 		 921 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  51.72 
 
 		 878 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 		 916 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 804 aa  636    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  49.49 
 
 		 888 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  51.3 
 
 		 896 aa  738    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  50.52 
 
 		 875 aa  745    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  50.39 
 
 		 904 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  52.74 
 
 		 929 aa  753    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  48.87 
 
 		 915 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 		 911 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  67.99 
 
 		 858 aa  1080    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  49.65 
 
 		 877 aa  758    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  49.09 
 
 		 908 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  49.32 
 
 		 882 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  50.17 
 
 		 916 aa  724    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  50.56 
 
 		 929 aa  690    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  49.78 
 
 		 923 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  49.32 
 
 		 907 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  51.66 
 
 		 877 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  50.11 
 
 		 879 aa  760    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 864 aa  1689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  46.7 
 
 		 919 aa  672    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  50.68 
 
 		 907 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  51.08 
 
 		 881 aa  779    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  50.79 
 
 		 898 aa  779    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  69.48 
 
 		 904 aa  1091    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  49.32 
 
 		 880 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  51.99 
 
 		 897 aa  769    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  44.17 
 
 		 914 aa  701    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  50.17 
 
 		 962 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  49.15 
 
 		 910 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 		 880 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  47.47 
 
 		 873 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  46.73 
 
 		 882 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 868 aa  611  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 804 aa  608  9.999999999999999e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 891 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 860 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.67 
 
 		 869 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 		 862 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  39.86 
 
 		 863 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 854 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 		 852 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 855 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 880 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 857 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 855 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 857 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 854 aa  569  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 859 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 863 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 870 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 855 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 872 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 871 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 857 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.92 
 
 		 878 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 855 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 862 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.08 
 
 		 871 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 855 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 858 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.29 
 
 		 870 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 858 aa  567  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 871 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 859 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 851 aa  565  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 887 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 881 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 		 851 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 859 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 		 851 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 870 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 851 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 853 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 823 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 853 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 884 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 884 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 897 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 861 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 927 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 851 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 860 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 855 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 872 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 882 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  36.69 
 
 		 853 aa  552  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>