237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2787 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  45.18 
 
 		 941 aa  732    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  49.32 
 
 		 928 aa  802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  47.17 
 
 		 934 aa  797    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  49.21 
 
 		 928 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  47.4 
 
 		 925 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  45.32 
 
 		 930 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  47.64 
 
 		 949 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  47.67 
 
 		 1029 aa  768    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  47.78 
 
 		 936 aa  771    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  50.94 
 
 		 936 aa  864    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  46.04 
 
 		 933 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  45.83 
 
 		 953 aa  736    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  44.51 
 
 		 938 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  47.79 
 
 		 932 aa  742    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  69.4 
 
 		 912 aa  1229    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  44.51 
 
 		 914 aa  697    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  49.32 
 
 		 928 aa  806    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  46.53 
 
 		 931 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  44.17 
 
 		 968 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  47.81 
 
 		 933 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  46.9 
 
 		 931 aa  774    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  45.2 
 
 		 893 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 935 aa  1887    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  51.07 
 
 		 931 aa  884    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  48.78 
 
 		 912 aa  789    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  46.39 
 
 		 934 aa  794    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  48.99 
 
 		 969 aa  788    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  44.17 
 
 		 968 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  45.35 
 
 		 937 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  44.62 
 
 		 936 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  45.37 
 
 		 943 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2766  (protein-PII) uridylyltransferase  69.75 
 
 		 487 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.66342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  47.17 
 
 		 931 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  45.12 
 
 		 941 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  45.55 
 
 		 930 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  45.32 
 
 		 930 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  47.28 
 
 		 934 aa  800    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  48.33 
 
 		 935 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  41.75 
 
 		 989 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2768  metal dependent phosphohydrolase  67.76 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.743155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.88 
 
 		 924 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.18 
 
 		 936 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  32.91 
 
 		 899 aa  475  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  34.03 
 
 		 902 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.1 
 
 		 894 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.16 
 
 		 894 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.53 
 
 		 894 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.77 
 
 		 893 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  33.84 
 
 		 856 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  36.06 
 
 		 899 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 898 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  34.59 
 
 		 900 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  35.86 
 
 		 899 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  34.59 
 
 		 900 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  34.17 
 
 		 877 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  34.51 
 
 		 900 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  33.45 
 
 		 906 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  34.35 
 
 		 857 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  35.48 
 
 		 862 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  36.11 
 
 		 859 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  34.39 
 
 		 900 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  35.59 
 
 		 858 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  33.25 
 
 		 852 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  34.39 
 
 		 900 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  33.82 
 
 		 900 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  36.15 
 
 		 859 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 891 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.22 
 
 		 900 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  34.27 
 
 		 900 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  35.19 
 
 		 862 aa  426  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  32.38 
 
 		 892 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.53 
 
 		 899 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  33.58 
 
 		 898 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  34.64 
 
 		 858 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  33.66 
 
 		 887 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  34.51 
 
 		 858 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  32.95 
 
 		 890 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  33.79 
 
 		 893 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 		 897 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  34.64 
 
 		 858 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 		 889 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  34.64 
 
 		 858 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  34 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  34.64 
 
 		 858 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  34.64 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  34.64 
 
 		 858 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  34.51 
 
 		 858 aa  416  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 892 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  33.95 
 
 		 869 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  34.18 
 
 		 850 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.8 
 
 		 905 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  33.18 
 
 		 881 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  33.94 
 
 		 898 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  33.74 
 
 		 904 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  34.8 
 
 		 859 aa  412  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  33.94 
 
 		 875 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  33.87 
 
 		 861 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  31.5 
 
 		 900 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  34.3 
 
 		 858 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  33.25 
 
 		 883 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>