More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2730 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  73.23 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  61.98 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  48.73 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  47.62 
 
 		 280 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  45.59 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  46.01 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  45.25 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  46.27 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  45.52 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  42.6 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  43.43 
 
 		 277 aa  204  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  39.03 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  42.6 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  44.65 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  44.65 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  44.49 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  40.34 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  41.48 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  40.74 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  43.45 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  42.12 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  44.2 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.45 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  41.45 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  40.89 
 
 		 315 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0137  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  40.62 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  40.74 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  40.89 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  43.64 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  44.16 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  40.79 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2006  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  44.53 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  44.53 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  39.03 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  39.41 
 
 		 274 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 276 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 276 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  42.28 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  45.26 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  45.05 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  47.17 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  40.54 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  46.39 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 387 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  44.69 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  43.91 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>