More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2686 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 147 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 142 aa  151  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 141 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 137 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  49.59 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.34 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  46.28 
 
 		 133 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 137 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  44.63 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  44.63 
 
 		 152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.35 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  43.75 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  42.28 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  40.65 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 141 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 142 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 142 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 143 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 139 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.6 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  42.74 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.44 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 135 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.17 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  43.8 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 		 134 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 139 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  40.83 
 
 		 134 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 138 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.15 
 
 		 144 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 138 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.15 
 
 		 134 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.15 
 
 		 134 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.52 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  42.74 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 128 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 136 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>