78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2670 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  66.08 
 
 
228 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  58.06 
 
 
207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.24 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.47 
 
 
212 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  32.47 
 
 
212 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.98 
 
 
221 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.82 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.49 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  32.02 
 
 
234 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.53 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  31.22 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.93 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.41 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  26.71 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.67 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.67 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.26 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.49 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.49 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.41 
 
 
339 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.72 
 
 
314 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.75 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  27.92 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.09 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.58 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.45 
 
 
312 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.92 
 
 
317 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.05 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.35 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  27.32 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.05 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  26.8 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.97 
 
 
315 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.95 
 
 
332 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.33 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.98 
 
 
313 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.76 
 
 
280 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.42 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  26.73 
 
 
233 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  28.87 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.45 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.45 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.9 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.67 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.72 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  26.29 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.29 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.34 
 
 
313 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  28.17 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.94 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.89 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.89 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.59 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.94 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.38 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.56 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.92 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.4 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.99 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.77 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.96 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.27 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.98 
 
 
210 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.39 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.45 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.63 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.78 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.06 
 
 
204 aa  42  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.82 
 
 
211 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.84 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.28 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>