More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2666 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  66.36 
 
 
209 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  60.66 
 
 
204 aa  236  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  40.21 
 
 
219 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  41.84 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.94 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  40.1 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.69 
 
 
222 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.58 
 
 
222 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  40.1 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  35.9 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  38.78 
 
 
223 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.66 
 
 
222 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  38.66 
 
 
222 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  39.69 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  40.82 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  39.18 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  41.33 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.14 
 
 
221 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  41.86 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  39.29 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  38.58 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  36.14 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.37 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  35.38 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.32 
 
 
217 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.32 
 
 
227 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  38.27 
 
 
224 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  39.29 
 
 
224 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  42.05 
 
 
218 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  40.2 
 
 
224 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  35.05 
 
 
220 aa  121  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  39.09 
 
 
234 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  39.55 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.73 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.25 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.87 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  36.87 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.98 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.81 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.08 
 
 
218 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  32.31 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  30.41 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  31.96 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  38.74 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  30.2 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  31.28 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  41.28 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  37.74 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  38.68 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  37.74 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  37.74 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  38.68 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.35 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.85 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  33.58 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  31.85 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  34.31 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  34.31 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.42 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  40 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.46 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  33.94 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.52 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.61 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.43 
 
 
828 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  30.2 
 
 
835 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  36.28 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  30.2 
 
 
843 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  30.2 
 
 
835 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  30.26 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.65 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  40.54 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.2 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 
812 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  33.55 
 
 
167 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.33 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  42.71 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.74 
 
 
833 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  33.33 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  26.7 
 
 
802 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  35 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  29.06 
 
 
818 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  31.8 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  39.18 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  30.3 
 
 
194 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  36.79 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  22.28 
 
 
817 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  39.25 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  28.11 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.12 
 
 
193 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.65 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  40.21 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>