More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2584 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
312 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  55.86 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 
301 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  52.92 
 
 
301 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 
301 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 
301 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  54.67 
 
 
326 aa  308  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  60.2 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  60.2 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  56.21 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.44 
 
 
304 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 
297 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  55.29 
 
 
299 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  58.21 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.61 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.27 
 
 
297 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 
300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  47.92 
 
 
300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 
305 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  45.58 
 
 
305 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 
313 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.22 
 
 
299 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 
299 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.22 
 
 
299 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  39.22 
 
 
299 aa  238  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 
299 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.93 
 
 
299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.58 
 
 
299 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.75 
 
 
298 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  39.58 
 
 
299 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.22 
 
 
299 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.22 
 
 
299 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 
305 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 
305 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  37.94 
 
 
295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 
302 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 
340 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 
315 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 
308 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  44 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  44.77 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  40 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 
352 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 
326 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  38.62 
 
 
331 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 
309 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
327 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 
298 aa  208  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  47.86 
 
 
300 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 
304 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  41.3 
 
 
314 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 
310 aa  205  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 
327 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 
304 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  39.86 
 
 
310 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.67 
 
 
312 aa  202  7e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  37.81 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.2 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  37.81 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  37.81 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.66 
 
 
312 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 
309 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  43 
 
 
308 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 
306 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 
303 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.25 
 
 
306 aa  199  6e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  42.07 
 
 
378 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  39.36 
 
 
340 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.01 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  35.76 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  40.56 
 
 
321 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  41.84 
 
 
313 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  44.86 
 
 
305 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 
298 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  42.33 
 
 
305 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.37 
 
 
356 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 
317 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 
398 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.24 
 
 
317 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 
320 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 
307 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
342 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 
306 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  40.69 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  45.39 
 
 
307 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 
313 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 
325 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.78 
 
 
312 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.78 
 
 
312 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  39.27 
 
 
325 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>