More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2535 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  100 
 
 		 463 aa  940    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  53.16 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  41.87 
 
 		 500 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  35.56 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  36.51 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  35.49 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  38.69 
 
 		 432 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  35.17 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  36.8 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  35.05 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  35.06 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.73 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  32.71 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.83 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.84 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.57 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.43 
 
 		 400 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.88 
 
 		 388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  28.67 
 
 		 467 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.94 
 
 		 412 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.52 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  26.52 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.54 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  25.12 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.54 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.33 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  27.21 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  27.21 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25.27 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.78 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.84 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.47 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.47 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.95 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  30.51 
 
 		 242 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.19 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 376 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.19 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.94 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.85 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.94 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.47 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.53 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.46 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.64 
 
 		 389 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  28.22 
 
 		 417 aa  94  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  27.67 
 
 		 423 aa  94  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  22.59 
 
 		 482 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  25.17 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  52.78 
 
 		 137 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.77 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  26.06 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.35 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  34.21 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.87 
 
 		 420 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.05 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.52 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  34.55 
 
 		 181 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  22.35 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  24.05 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  21.78 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  25.32 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.57 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.57 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.13 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.42 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  23.91 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.67 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  24.15 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  20.49 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  27.19 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  24.76 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  29.67 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.4 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  23.84 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.48 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.05 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  22.67 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  22.9 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>