32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2527 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 292 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.38 
 
 		 291 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.17 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.17 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.94 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  32.68 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.65 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.6 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.98 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.13 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  29.19 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.35 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  30.81 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  30.05 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  31.77 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  30.67 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  25.48 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  27.17 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  31.71 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.25 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  22.29 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  27.05 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  22.06 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>