More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2512 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  69.43 
 
 		 767 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  69.13 
 
 		 745 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  100 
 
 		 479 aa  962    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  68.37 
 
 		 767 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  63.15 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  59.67 
 
 		 476 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  47.85 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  46.57 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  46.57 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  50.22 
 
 		 548 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  48.08 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  48.07 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  46.82 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  45.49 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  48.54 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  44.85 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  43.92 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  47.48 
 
 		 562 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  43.88 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  47.02 
 
 		 564 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  49.11 
 
 		 541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  46.82 
 
 		 564 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  46.93 
 
 		 561 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  47.54 
 
 		 561 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  42.36 
 
 		 550 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  47.54 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  47.54 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  46.54 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  47.32 
 
 		 561 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  47.54 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  47.32 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  46.65 
 
 		 561 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  46.33 
 
 		 560 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  45.25 
 
 		 547 aa  349  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  45.74 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  42.45 
 
 		 552 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  46.11 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  45.04 
 
 		 547 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  42.83 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.3 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  46.54 
 
 		 562 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  44.79 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  45.88 
 
 		 561 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  45.49 
 
 		 557 aa  336  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  45.49 
 
 		 562 aa  332  9e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  41.23 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  43.1 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  46.14 
 
 		 478 aa  316  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  41.13 
 
 		 482 aa  315  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  39.53 
 
 		 469 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  42.41 
 
 		 476 aa  309  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  41.56 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  41.56 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  41.56 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  38.81 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.63 
 
 		 469 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  41.26 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  41.05 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  38.68 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  37.5 
 
 		 485 aa  290  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  43.16 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  36.88 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  39.79 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  38.71 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.5 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  36.58 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.85 
 
 		 448 aa  276  4e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.43 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.46 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  38.28 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  37.2 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1205  mercuric reductase  40.79 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.08 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.84 
 
 		 456 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.28 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.78 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.13 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 		 470 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  33.63 
 
 		 459 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  35.54 
 
 		 500 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.99 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.91 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.24 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 		 462 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 458 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.92 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  35.88 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  34.82 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  34.92 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  35.56 
 
 		 720 aa  233  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.77 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>