More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2505 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2505  TonB-dependent receptor  100 
 
 
747 aa  1501  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00363103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
751 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  8.75615e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
720 aa  176  1e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
792 aa  175  3e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 
739 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
713 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
771 aa  168  3e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
794 aa  166  1e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
763 aa  164  8e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
732 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
700 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 
695 aa  158  5e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
796 aa  157  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  2.8196e-07  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
790 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.12 
 
 
715 aa  156  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
795 aa  155  3e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
702 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  5.40128e-05  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
780 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
765 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
803 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
808 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 
786 aa  149  2e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
712 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 
775 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
704 aa  147  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
747 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
724 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 
743 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
784 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
777 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
755 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
756 aa  143  1e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
777 aa  143  1e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 
817 aa  141  4e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
753 aa  140  8e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
794 aa  140  9e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  9.82846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
761 aa  140  9e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
733 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
761 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
779 aa  139  3e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
771 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
769 aa  137  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
766 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 
822 aa  136  1e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  2.24426e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
764 aa  135  2e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
732 aa  134  4e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 
743 aa  134  8e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
713 aa  134  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
753 aa  133  1e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
771 aa  133  1e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
802 aa  132  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 
809 aa  133  2e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
780 aa  132  2e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
851 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
710 aa  131  5e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
822 aa  131  5e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
743 aa  130  7e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
796 aa  130  9e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
848 aa  130  9e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 
726 aa  130  1e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
764 aa  129  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.45148e-11  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
802 aa  129  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
773 aa  128  4e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 
755 aa  128  4e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 
777 aa  128  4e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
771 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
814 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
723 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 
786 aa  125  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
753 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 
755 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 
785 aa  124  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 
757 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
773 aa  124  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
853 aa  124  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 
969 aa  123  1e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
717 aa  122  2e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
789 aa  122  2e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
737 aa  122  2e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 
838 aa  121  4e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
775 aa  121  4e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 
851 aa  121  4e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
767 aa  121  4e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  25.33 
 
 
785 aa  119  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
730 aa  120  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  7.40519e-09  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
729 aa  119  2e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
784 aa  119  2e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
736 aa  119  2e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
855 aa  119  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
735 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  2.17846e-11  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 
763 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
680 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 
776 aa  118  4e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
769 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.26 
 
 
755 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 
790 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 
803 aa  117  7e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
818 aa  117  8e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  25.52 
 
 
856 aa  117  9e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
873 aa  117  1e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>