More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2403 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  216  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  57.8 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  57.69 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 291 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  50.46 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  52.83 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  54.13 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  48.11 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3420  regulatory protein, ArsR  49.54 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  45.37 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  48.62 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  47.71 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  45.87 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.04 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  44.95 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 287 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  42.2 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 298 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  44.55 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  44.04 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  43.62 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  43.75 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  42.16 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.87 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  42.39 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  44.04 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 		 270 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 270 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  38.1 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 284 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  42.35 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>