285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2374 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  100 
 
 
142 aa  288  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  60.71 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  60.71 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  60.71 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  57.86 
 
 
144 aa  167  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  60 
 
 
140 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  55.8 
 
 
143 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0742  OsmC-like protein  55.22 
 
 
143 aa  156  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  55.71 
 
 
142 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  54.93 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  51.41 
 
 
142 aa  153  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  52.45 
 
 
143 aa  152  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  53.57 
 
 
143 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4674  OsmC family protein  53.52 
 
 
142 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  51.75 
 
 
143 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  51.75 
 
 
143 aa  150  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  51.75 
 
 
143 aa  150  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  51.75 
 
 
143 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  51.75 
 
 
143 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  51.75 
 
 
143 aa  150  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  56.3 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  53.68 
 
 
141 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  53.68 
 
 
151 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  50.7 
 
 
143 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  51.05 
 
 
143 aa  148  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  53.28 
 
 
141 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  50.35 
 
 
142 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  55.07 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  52.14 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  53.33 
 
 
141 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  51.43 
 
 
143 aa  143  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  51.43 
 
 
143 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  48.95 
 
 
143 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  48.95 
 
 
143 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  48.95 
 
 
143 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  48.95 
 
 
143 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  48.95 
 
 
143 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  51.85 
 
 
141 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000509604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  50 
 
 
143 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  51.75 
 
 
145 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  51.75 
 
 
145 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  52.21 
 
 
141 aa  140  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  51.85 
 
 
136 aa  140  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  51.11 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  51.11 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  53.24 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  52.11 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  50 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  49.29 
 
 
140 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  54.84 
 
 
143 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  53.44 
 
 
161 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  47.89 
 
 
142 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  48.89 
 
 
140 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  46.81 
 
 
138 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1691  peroxiredoxin OsmC  55.17 
 
 
116 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  52.21 
 
 
138 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  49.65 
 
 
145 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  53.03 
 
 
140 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  50 
 
 
140 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  50 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  50 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  50.36 
 
 
141 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1350  OsmC family protein  51.13 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  49.62 
 
 
165 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  47.1 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  49.65 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  47.1 
 
 
141 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0924  OsmC family protein  48.92 
 
 
140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  50 
 
 
136 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  46.43 
 
 
146 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5223  OsmC family protein  47.1 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610628  normal  0.18726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  51.05 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  50.74 
 
 
138 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  48.25 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  48.28 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3133  OsmC family protein  47.55 
 
 
143 aa  114  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0138842  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  46.1 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  44.85 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  48.23 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0962  OsmC family protein  48.18 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  45.77 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  45.71 
 
 
141 aa  105  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  43.57 
 
 
146 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  42.45 
 
 
145 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  46.15 
 
 
140 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  46.1 
 
 
141 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4793  peroxiredoxin, OsmC subfamily  43.84 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5587  peroxiredoxin, OsmC subfamily  45.24 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  41.35 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  44.37 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6705  OsmC-like protein  43.08 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252159  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  44.37 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0697  putative ATP/GTP binding protein  43.26 
 
 
141 aa  95.9  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  41.96 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1608  OsmC family protein  42.66 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.486647  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  43.51 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2232  OsmC family protein  41.43 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2185  OsmC family protein  44.29 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4494  OsmC family protein  44.06 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.015469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>