271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2360 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  62.58 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  56.33 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  53.57 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  53.85 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  51.52 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  52.47 
 
 		 292 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  53.01 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  46.43 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 169 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 179 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  50.97 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.47 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 209 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  44.51 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  48.75 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  40.13 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  41.88 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  40.59 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.52 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  46.94 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.21 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 187 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  40.46 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>