218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2359 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
393 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  69.15 
 
 
394 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  52.99 
 
 
388 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  50.83 
 
 
387 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  49.22 
 
 
390 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  50.39 
 
 
386 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  48.66 
 
 
411 aa  360  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  45.36 
 
 
397 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  50.41 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  50.81 
 
 
389 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  52.63 
 
 
223 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.64 
 
 
333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.07 
 
 
311 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.18 
 
 
315 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  33.04 
 
 
313 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.95 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.83 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  34.76 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.49 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.52 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.2 
 
 
311 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.56 
 
 
444 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  29.01 
 
 
415 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  26.76 
 
 
312 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.73 
 
 
311 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  30.47 
 
 
352 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  30.94 
 
 
438 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.61 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.11 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.91 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  32.27 
 
 
306 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  24.31 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.81 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.07 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27.22 
 
 
602 aa  116  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  28.49 
 
 
338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  29.65 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.37 
 
 
419 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  27.82 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.82 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  26.52 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  29.81 
 
 
344 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30.88 
 
 
412 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.13 
 
 
355 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.15 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  29.54 
 
 
320 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.34 
 
 
444 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  27.09 
 
 
392 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.51 
 
 
394 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  32.31 
 
 
307 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  28.42 
 
 
346 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.54 
 
 
345 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  24.9 
 
 
405 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  30.04 
 
 
429 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  24.26 
 
 
297 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.12 
 
 
348 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  29.23 
 
 
307 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  33.85 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  26.29 
 
 
342 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  26.17 
 
 
449 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  34.74 
 
 
324 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  27.16 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.05 
 
 
412 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  27.82 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.05 
 
 
433 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  25.9 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  29.65 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.02 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.39 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  23.3 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6399  peptidase M19 renal dipeptidase  35.02 
 
 
485 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  38.1 
 
 
315 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  38.24 
 
 
344 aa  96.3  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.36 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  28.8 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  24.94 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  29.67 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  29.12 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  24.71 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.38 
 
 
307 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  28.53 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  31.65 
 
 
352 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  22.39 
 
 
439 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  30.89 
 
 
307 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  28.94 
 
 
310 aa  93.2  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  27.99 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  29.32 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  29.32 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  29.32 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  28.99 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  28.72 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  28.8 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  29.84 
 
 
307 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  26.04 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  28.8 
 
 
307 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.65 
 
 
307 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  28.72 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2576  peptidase M19, renal dipeptidase  31.61 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.41 
 
 
337 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>