17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2342 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  53.85 
 
 		 231 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  42.45 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  27.03 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  23.68 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  23.96 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  21.24 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  26 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  22.28 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  22.68 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  22.45 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  23.03 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  24.35 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  24.18 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  18.5 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  22.88 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  22.4 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>