More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2328 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  62.11 
 
 		 806 aa  967    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  70.14 
 
 		 795 aa  1103    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 786 aa  1579    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  60.86 
 
 		 802 aa  947    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  61.82 
 
 		 797 aa  941    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 763 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 757 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 807 aa  299  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 747 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 802 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 753 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 791 aa  281  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 785 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  31 
 
 		 822 aa  279  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 771 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.02 
 
 		 784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 795 aa  253  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 762 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 780 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 		 889 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 780 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 742 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 781 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 808 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 712 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 777 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 875 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.55 
 
 		 856 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 795 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 904 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 763 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 751 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 743 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 737 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 753 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 700 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 732 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 847 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 846 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 702 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 788 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 		 830 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 883 aa  171  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 752 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 808 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 778 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 774 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 794 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 778 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 808 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 724 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 747 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 790 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 766 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 739 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 730 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 795 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 764 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 903 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 790 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 794 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 771 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 767 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 762 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 754 aa  151  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 757 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 729 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 825 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 756 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 764 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 798 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 769 aa  149  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 792 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 731 aa  148  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 797 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 797 aa  146  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 809 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 780 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 815 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 763 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 730 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 776 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 736 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>