184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2325 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.39 
 
 
230 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.79 
 
 
245 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.92 
 
 
285 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.22 
 
 
285 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.85 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  47.14 
 
 
240 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.14 
 
 
240 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.14 
 
 
240 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.95 
 
 
236 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.05 
 
 
287 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.47 
 
 
292 aa  141  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.5 
 
 
299 aa  141  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  44.25 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.71 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.27 
 
 
271 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
259 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.81 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.23 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.64 
 
 
269 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.48 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.64 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.21 
 
 
263 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.21 
 
 
263 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.21 
 
 
258 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.9 
 
 
255 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.65 
 
 
278 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 
232 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.91 
 
 
228 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
242 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.23 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
233 aa  88.6  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
260 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
328 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
283 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.34 
 
 
338 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  35.34 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.88 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.05 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.34 
 
 
1153 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
837 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.72 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.11 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
808 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.28 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.36 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.24 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  27.39 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  25.31 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  25.31 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 
251 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  27.71 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  28.63 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.84 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 
287 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  30.52 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  27.98 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  32.78 
 
 
316 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.16 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>