More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2295 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  77.97 
 
 		 574 aa  921    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  70.94 
 
 		 585 aa  855    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 839 aa  1699    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  46.61 
 
 		 601 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 		 584 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  43.9 
 
 		 608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  48.69 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  45.14 
 
 		 576 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  45.14 
 
 		 576 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  45.14 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  44.44 
 
 		 603 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  45.32 
 
 		 576 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  45.14 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  44.77 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.63 
 
 		 4336 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.13 
 
 		 4336 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  34.1 
 
 		 936 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 586 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  33.9 
 
 		 852 aa  296  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.86 
 
 		 4332 aa  295  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  37.08 
 
 		 3231 aa  293  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.38 
 
 		 4318 aa  290  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.21 
 
 		 4317 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.21 
 
 		 4342 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.21 
 
 		 4317 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.05 
 
 		 4317 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 958 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.44 
 
 		 4317 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.75 
 
 		 4342 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.95 
 
 		 1801 aa  277  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 962 aa  274  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 947 aa  272  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.6 
 
 		 3208 aa  271  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 942 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.23 
 
 		 1656 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.58 
 
 		 2820 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 949 aa  268  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.38 
 
 		 1067 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.16 
 
 		 2791 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 592 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 958 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.37 
 
 		 2250 aa  260  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.32 
 
 		 1779 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.99 
 
 		 1776 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 614 aa  257  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.94 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.58 
 
 		 581 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.72 
 
 		 2997 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 1035 aa  250  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 595 aa  250  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  33.02 
 
 		 3235 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.84 
 
 		 6403 aa  248  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 613 aa  247  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  32.31 
 
 		 1789 aa  246  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 611 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.78 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 		 629 aa  244  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 725 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 602 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 597 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.22 
 
 		 3718 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 597 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 725 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 586 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  34.15 
 
 		 1981 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.13 
 
 		 629 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 653 aa  240  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  29.46 
 
 		 2753 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.97 
 
 		 629 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.97 
 
 		 629 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.14 
 
 		 2762 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 547 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 578 aa  237  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.76 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 608 aa  234  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.8 
 
 		 3099 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 610 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 599 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.99 
 
 		 637 aa  232  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.92 
 
 		 7122 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  30.49 
 
 		 564 aa  231  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  30.49 
 
 		 559 aa  231  5e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 610 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  33.08 
 
 		 2103 aa  230  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 648 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 610 aa  227  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  33.03 
 
 		 559 aa  227  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 599 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 599 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  32.33 
 
 		 2721 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  33.21 
 
 		 606 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 701 aa  227  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.66 
 
 		 563 aa  226  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 706 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  31.71 
 
 		 1474 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>