24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2241 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2241  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1306  hypothetical protein  51.43 
 
 
188 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.47922  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1676  hypothetical protein  38.85 
 
 
261 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2772  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44300  hypothetical protein  37.4 
 
 
278 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3414  hypothetical protein  37.74 
 
 
256 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.837558  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3069  hypothetical protein  40.44 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659894  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0401  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2497  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
280 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0057  hypothetical protein  28.4 
 
 
261 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2213  hypothetical protein  32.96 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0096  hypothetical protein  25.95 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0203  hypothetical protein  26.77 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0301565  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2095  hypothetical protein  28.74 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0060  hypothetical protein  30.28 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0074  hypothetical protein  30.08 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0066  hypothetical protein  27.38 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0601  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  23.89 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0196  hypothetical protein  25.82 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1536  hypothetical protein  21.63 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21350  hypothetical protein  20.88 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2217  hypothetical protein  27.51 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1909  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.9 
 
 
453 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1725  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.65 
 
 
453 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>