More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2240 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  67.89 
 
 
246 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  53.81 
 
 
262 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  48.41 
 
 
263 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  50.6 
 
 
256 aa  228  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  43.98 
 
 
261 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  45.42 
 
 
247 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.65 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.05 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.81 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  27.13 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  27.97 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.85 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  33.7 
 
 
247 aa  89  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  27.38 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  25.38 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.61 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  38.81 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  24.59 
 
 
241 aa  82  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.35 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  26.59 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.64 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  29.23 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.22 
 
 
393 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.89 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.23 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.98 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.41 
 
 
393 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28.23 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  26.92 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  32.76 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  31.9 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  35.04 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  27.81 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.15 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  24.9 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.78 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  24.9 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  35.85 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  25.2 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  27.87 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  33.8 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.67 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.08 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  22.45 
 
 
630 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  24.28 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  25.73 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  40.45 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  28.86 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  35.43 
 
 
391 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
384 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  29.32 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  27.46 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  28.14 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.8 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  32.12 
 
 
439 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  27.87 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.05 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
388 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 
596 aa  65.5  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  27.31 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  26.19 
 
 
362 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  35.83 
 
 
854 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  36.59 
 
 
348 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  31.79 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  28.68 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  25.1 
 
 
616 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  27.2 
 
 
393 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  23.29 
 
 
411 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.11 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25.24 
 
 
564 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  25 
 
 
399 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  27.17 
 
 
364 aa  62.4  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  35.2 
 
 
391 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  26.5 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.31 
 
 
374 aa  62  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 
246 aa  62  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  31.07 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  25.32 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>