128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2226 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 119 aa  251  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  53.68 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.04 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  51.61 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  51.65 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  51.65 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.26 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.13 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  52.75 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  52.08 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.11 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  45.45 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  52.94 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.69 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.81 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  52.94 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  48.42 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  53.49 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  50.55 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  48.35 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  47.19 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  49.45 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  49.45 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  47.73 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  47.73 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  46.39 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  47.25 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  45.36 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  50.53 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  50.57 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  47.31 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  49.4 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  43.82 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  44.57 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.05 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  44.19 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.7 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.71 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  40.43 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  44.16 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  41.03 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  52.46 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  40.24 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  35.85 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  32.1 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  32.47 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  35.44 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>