96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2216 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  288  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  41.84 
 
 
153 aa  108  2e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  43.88 
 
 
151 aa  108  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  43.17 
 
 
153 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  45.59 
 
 
150 aa  107  8e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  40.69 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  40.71 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  41.72 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  39.04 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  40.43 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  42.03 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  39.31 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  39.31 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  35.29 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  40.29 
 
 
152 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  40.29 
 
 
152 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.72435e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  40.29 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  40.29 
 
 
152 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  40.29 
 
 
152 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  45.39 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  43.88 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  39.57 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  39.57 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  40.88 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  37.68 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  39.42 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  40.14 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  41.61 
 
 
151 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  37.78 
 
 
143 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  37.78 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  39.01 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  35.37 
 
 
149 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  39.72 
 
 
153 aa  82.8  1e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  42.54 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  42.22 
 
 
148 aa  80.5  7e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  41.91 
 
 
149 aa  80.1  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  38.24 
 
 
150 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  40.85 
 
 
150 aa  79  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  40.85 
 
 
150 aa  79  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  40.85 
 
 
150 aa  79  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  40.85 
 
 
150 aa  79  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  38.13 
 
 
149 aa  78.2  3e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  34.27 
 
 
151 aa  76.6  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  28.57 
 
 
153 aa  76.3  2e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  40.5 
 
 
147 aa  73.6  9e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  71.6  3e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  36.62 
 
 
149 aa  71.6  3e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  71.6  3e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  39.42 
 
 
151 aa  67.4  6e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  27.54 
 
 
153 aa  67.4  7e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  38.93 
 
 
156 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  33.12 
 
 
165 aa  65.5  2e-10  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  29.71 
 
 
150 aa  65.1  3e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  32.35 
 
 
147 aa  62.8  2e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  35.04 
 
 
149 aa  62  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  32.17 
 
 
154 aa  57.8  6e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  56.6  1e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  56.2  2e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  29.25 
 
 
157 aa  54.7  4e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  54.7  5e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  28.87 
 
 
150 aa  54.3  5e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.74 
 
 
145 aa  53.9  7e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  33.77 
 
 
165 aa  52  3e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  31.25 
 
 
154 aa  51.6  3e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  29.93 
 
 
143 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  28.26 
 
 
145 aa  50.4  9e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  29.93 
 
 
151 aa  48.9  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  30.92 
 
 
153 aa  48.9  3e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  30.99 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.89934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  25.69 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  32.47 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  32.19 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  32.19 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  28.86 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54909e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  30.72 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  27.66 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.94 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  29.73 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  29.73 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  29.73 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.60855e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  30.92 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.06621e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.83526e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  28.76 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.58021e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  29.73 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  29.45 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>