279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2195 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
87 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  59.52 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.14 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.44 
 
 
83 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.58 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.38 
 
 
83 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.38 
 
 
83 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.16 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.7 
 
 
83 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.43 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.44 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.94 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.68 
 
 
84 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.43 
 
 
83 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.85 
 
 
83 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.97 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.97 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.97 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.16 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.16 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.97 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  48.19 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.63 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.79 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55.56 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.68 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.05 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.5 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
82 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.55 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.89 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.48 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.48 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.44 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  47.46 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
86 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.48 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.07 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.66 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.24 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.85 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.25 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.25 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.25 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.31 
 
 
92 aa  57  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.82 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.25 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
61 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.82 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.25 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.25 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.12 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  43.33 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.03 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.84 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.43 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 
61 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.92 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
76 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.03 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  44.12 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
76 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  45.07 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.17 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>