More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2158 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  60.26 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  58.93 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  50.53 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  52.07 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  43.06 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  43.77 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  39.7 
 
 		 357 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  39.16 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  38.49 
 
 		 375 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  39.56 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  38.51 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  39.09 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  41.34 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  38.06 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  38.36 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  35.8 
 
 		 420 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  39.81 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  40.13 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  40.13 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  36.84 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  42.01 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  41.56 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  37.46 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  35.39 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.49 
 
 		 435 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  42.24 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  38.55 
 
 		 371 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.07 
 
 		 426 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  40.79 
 
 		 427 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  41.9 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  46.93 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  44.05 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  36.74 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.97 
 
 		 340 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  44.78 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  41.77 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  41.77 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  35.93 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  37.93 
 
 		 443 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  44.29 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  34.6 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  35.14 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  34.94 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  35.08 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  37.28 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  34.18 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  39.64 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  41.8 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  34.62 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  33.67 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 		 447 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.44 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  44.8 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  37.7 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  35.89 
 
 		 279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  35.89 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  35.85 
 
 		 421 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  35.19 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  32.56 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  39.9 
 
 		 425 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  35.87 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  36.12 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  37.39 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  37.89 
 
 		 451 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  41.55 
 
 		 447 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  35.54 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  35.89 
 
 		 279 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  36.07 
 
 		 426 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  35.81 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  35.81 
 
 		 421 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  33.45 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  35.19 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  34.31 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  34.95 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  34.43 
 
 		 452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  33.33 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_002978  WD1027  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  35.19 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  35.07 
 
 		 454 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  35.19 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.77 
 
 		 446 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>