More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2091 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 735 aa  1495    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  49.3 
 
 		 707 aa  618  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 755 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 727 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  38.32 
 
 		 693 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  39.95 
 
 		 724 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 755 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 724 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 756 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  41.58 
 
 		 705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  39.16 
 
 		 771 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  39.15 
 
 		 719 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 792 aa  307  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 719 aa  298  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 710 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 770 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 715 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 706 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 706 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 710 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 707 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 709 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 757 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 734 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  31.87 
 
 		 695 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 734 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 736 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 860 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 745 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 708 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 732 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 712 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  28.86 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 749 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 656 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 710 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 689 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 731 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.06 
 
 		 711 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 732 aa  234  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 821 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 698 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 769 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 689 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 700 aa  227  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 748 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  28.87 
 
 		 748 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 748 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 748 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 747 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 742 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 711 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 742 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 747 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 747 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  29.43 
 
 		 772 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 747 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 766 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 760 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 753 aa  221  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 747 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.77 
 
 		 706 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.86 
 
 		 708 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 747 aa  217  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 740 aa  217  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 747 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 760 aa  216  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  28.12 
 
 		 760 aa  216  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  28.12 
 
 		 760 aa  216  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 769 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  28.39 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  28.39 
 
 		 760 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 708 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 837 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 817 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 751 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  28.26 
 
 		 760 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  28.26 
 
 		 760 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 709 aa  214  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 743 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 705 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  28.1 
 
 		 743 aa  214  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.33 
 
 		 709 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  28.12 
 
 		 760 aa  213  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 826 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 733 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 733 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 733 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.22 
 
 		 680 aa  211  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 734 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 741 aa  210  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 759 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  30.13 
 
 		 678 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.32 
 
 		 703 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 751 aa  208  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 733 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>