More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2082 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  100 
 
 		 371 aa  729    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  48.58 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  47.02 
 
 		 349 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  43.99 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  41.14 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  44.52 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  44.52 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  36.07 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  37.29 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  44.19 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  37.38 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  36.74 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  37.57 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.18 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.15 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.18 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  33.43 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.18 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.79 
 
 		 422 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  34.8 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  32.83 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  38.11 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  37.73 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  36.8 
 
 		 475 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 		 475 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  37.79 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 		 470 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  34.99 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  36.98 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  34.28 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.02 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.32 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.02 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  35.92 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  33.73 
 
 		 402 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.18 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  32.95 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.8 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  35.46 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  33.81 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  38.2 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  38.24 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.13 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  33.6 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  31.76 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  34.25 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  36.71 
 
 		 404 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  31.71 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  36.72 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  31.47 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  33.52 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  33.43 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  35.74 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  34.85 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  36.11 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  33.43 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  37.26 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  35.12 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  34.89 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  33.14 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  33.79 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  34.68 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  37.93 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  33.54 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  34.68 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.18 
 
 		 387 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3115  secretion protein HlyD  35.81 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  31.77 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  35.88 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.18 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>