More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2063 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  100 
 
 
335 aa  672    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  76.58 
 
 
360 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  75.71 
 
 
348 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  58.49 
 
 
333 aa  359  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  55.42 
 
 
349 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  55.09 
 
 
363 aa  348  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  55.21 
 
 
342 aa  348  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  55.11 
 
 
350 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  56.89 
 
 
357 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  55.26 
 
 
351 aa  344  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  54.19 
 
 
353 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  56.05 
 
 
327 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  55.27 
 
 
327 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  51.18 
 
 
348 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  53.87 
 
 
346 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  53.87 
 
 
346 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  55.95 
 
 
370 aa  325  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  51.96 
 
 
373 aa  321  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  53.21 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  53.25 
 
 
339 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  54.46 
 
 
345 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  52.85 
 
 
322 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  54.31 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  52.12 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  52.28 
 
 
368 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  52.58 
 
 
368 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  53.29 
 
 
368 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  54.63 
 
 
338 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  53.73 
 
 
365 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  52.55 
 
 
349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  53.38 
 
 
351 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  49.55 
 
 
352 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  52.56 
 
 
351 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  50.92 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  51.91 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  52.88 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  52.38 
 
 
369 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  51.16 
 
 
315 aa  296  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  50.47 
 
 
338 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  50.49 
 
 
323 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  50.5 
 
 
315 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  50.5 
 
 
315 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  51.64 
 
 
326 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  50.46 
 
 
364 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  51.33 
 
 
319 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  51.32 
 
 
326 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  51.33 
 
 
348 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  49.67 
 
 
359 aa  288  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  49.06 
 
 
347 aa  288  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  51.16 
 
 
316 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  49.68 
 
 
341 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  49.68 
 
 
340 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  49.68 
 
 
327 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  50 
 
 
353 aa  285  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  51.97 
 
 
341 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  50.66 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  47.18 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  48.97 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  50 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  52.6 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  52.33 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  52.6 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  52.6 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  50 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  49.23 
 
 
350 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  49.55 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  48.89 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  50.67 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  48.57 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0575  PhoH family protein  49.84 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0928819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  51.58 
 
 
374 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  50.5 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  49.01 
 
 
345 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  50.16 
 
 
339 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  51.95 
 
 
355 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  48.03 
 
 
328 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  47.8 
 
 
365 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  49.68 
 
 
335 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  50.67 
 
 
319 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  48.35 
 
 
365 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  50.99 
 
 
328 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  51.62 
 
 
354 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  51.62 
 
 
347 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  51.62 
 
 
354 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  51.49 
 
 
320 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  49.35 
 
 
335 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  49.03 
 
 
342 aa  278  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  50.79 
 
 
346 aa  278  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  50.66 
 
 
338 aa  278  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  49.01 
 
 
340 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  49.55 
 
 
356 aa  278  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  51.17 
 
 
334 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  48.81 
 
 
352 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  44.48 
 
 
379 aa  278  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>