61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2062 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2062  DoxX  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  50.81 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  51.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  47.9 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  49.6 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  48.03 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  50 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  42.19 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  43.44 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  42.62 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  51.28 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  44.26 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  44.53 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  41.27 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  40.16 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  42.11 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  44.35 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  42.24 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  43.24 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  43.1 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  43.2 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  43.55 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  38.81 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  46.28 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  38.21 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  42.73 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  42.5 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  42.97 
 
 		 180 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  42.97 
 
 		 180 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  42.97 
 
 		 180 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  46.02 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  40.98 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  41.6 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  38.81 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  36.44 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  40 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  40.71 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  36.92 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  39.1 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  38.66 
 
 		 136 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  40.52 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  34.38 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  34.38 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  41.51 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  37.93 
 
 		 153 aa  66.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.83 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.45 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  37.01 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.97 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.5 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.11 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  32.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3783  DoxX family protein  31.13 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3834  DoxX family protein  31.13 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  31.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.46 
 
 		 151 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  25.98 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  29.46 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>