122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2054 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.54 
 
 
279 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.81 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.64 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.92 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.05 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.05 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.08 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.75 
 
 
133 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  35.29 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.66 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.64 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  30 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.4 
 
 
126 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.34 
 
 
153 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.58 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  32.98 
 
 
135 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.11 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.45 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.48 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  34.83 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.09 
 
 
150 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.14 
 
 
257 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.79 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.79 
 
 
165 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.93 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.82 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.82 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0330  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.78 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0518178  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  29.46 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0188  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.35 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4755  hypothetical protein  31.76 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.82 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.11 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2275  hypothetical protein  30.33 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.74 
 
 
181 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  48.98 
 
 
197 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.15 
 
 
365 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.33 
 
 
137 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.29 
 
 
137 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.23 
 
 
354 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.93 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.08 
 
 
524 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.58 
 
 
181 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 
151 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  34.41 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.71 
 
 
167 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.71 
 
 
167 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  40.85 
 
 
246 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.71 
 
 
167 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.48 
 
 
169 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0401  SH3 type 3 domain-containing protein  34.62 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3801  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.66 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.62 
 
 
171 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  33 
 
 
166 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.21 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.69 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  31.68 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  32.46 
 
 
478 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.46 
 
 
478 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0572  membrane protein-like  39.53 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.85 
 
 
152 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.49 
 
 
221 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  31.25 
 
 
137 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  31.68 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.57 
 
 
278 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.12 
 
 
148 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  34.02 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.68 
 
 
397 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 
145 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.88 
 
 
144 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.89 
 
 
154 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.89 
 
 
335 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0673  hypothetical protein  30.61 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.44 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.08 
 
 
138 aa  45.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1028  putative lipoprotein  29.07 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.78 
 
 
138 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.78 
 
 
138 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  32.86 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.78 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0974  putative lipoprotein  29.07 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.78 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1173  putative lipoprotein  29.07 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.891914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.8 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  31.65 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  30.86 
 
 
135 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.65 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>